Die Orgel wurde im Jahr 1967 von Orgel-Baumeister Eduard Wagenbach aus Limburg gebaut. Damals fand das Hauptwerk Aufstellung auf der neu errichteten Empore, das Positiv war als Fernwerk auf der alten Empore aufgestellt. Im Jahr 1999 entschloss sich die Kirchengemeinde Nomborn zu einem Umbau der Orgel. Dabei wurde das Fernwerk in die Orgel übertragen und das ganze Instrument um zwei Register erweitert. Sie tönt mit 13 klingenden Registern und 900 Pfeifen. Die Orgel erhielt ein neues Gehäuse aus Eichenholz. Die Arbeiten führte Orgel-Baumeister Reinhart Tzschöckel aus Althütte-Fautspach in Schwaben aus. Die Gesamtkosten von etwa 70.000 DM wurden durch Spenden aufgebracht.